Поисковые системы индексируют по ссылкам только адреса страниц, на которых содержатся записи. Адреса шаблонов не имеют никакого значения для поисковиков. Однако не стоит очень часто менять шаблон. Выбирайте подходящий и продвигайте сайт.
интересно... никогда не думал об этом...
может быть лучше написать в гошу и в яндекс в службу поддержки, и спросить у них, чтобы не получилось так, что поисковики посчитают материалы на сайте с разными адресами копипастом?
мне кажется это лучше- спросить у спецов, чем мы будем тут гадать.