Посоветуйте по интернет магазину, что вы считаете правильно сделать. Он в разработке
Теперь непосредственно по элементам:
1. Меню:
a. Как и где расположить меню
b. В какой последовательности расположить все. Сейчас все нагромождено.
c. Как удобно для пользователя организовать субкатегории
d. Как выводить товар по производителю
Сейчас выводятся только те товары, которые отмечены, что их надо выводить на главной. Это неправильно. Правильнее выводить новинки, акции, популярные и прочее. Как и где расположить соответствующие блоки (размеры изображений, естественно, можно будет менять). Где написать/разместить блоки о компании, доставке. Где разместить корзину, чтобы она была четко видна посетителям.
Где расположить поиск. Также предполагается интеграция с Гугл или Яндекс поиском.
Помимо всего прочего, при поиске можно использовать отображение по канальности, категория, тип и пр., по тегам
Понятно что продавать. Магазины бывают разные, можно самому заказывать товары и перепродавать, а можно поставить партнерку какого нибудь магазина. Какой движок сайта?