Во-первых, хорошо бы замерить скорость записи/чтения флешки при помощи утилит, например Сheck Flash.
Во-вторых, попробуйте скопировать файл не при помощи проводника виндовс, а, например, тотал коммандером. В нём можно изменить размер буфера при копировании.
Настройка -> операции с файлами -> Также использовать режим буфера для больших файлов -> Источник и получатель на разных дисках. Установите какое-нибудь большое значение, например, 102400 кб.